当前课程知识点：Resistance to Antibacterial Agents > W4 Origin of antibiotic resistance and dessimination > W4.3 - Role of the environment > Video
返回《Resistance to Antibacterial Agents》慕课在线视频课程列表
返回《Resistance to Antibacterial Agents》慕课在线视频列表
大家好 我是玛丽 塞西尔 普洛依
我是法国利摩日
大学医院的一名微生物学家
这一章节的目标是了解
环境在研究抗生素耐药性
中所扮演的角色
我们为何要讨论环境的作用呢
因为细菌并不设边界
它们可以在所有生态系统之间传播
人类 动物以及环境方面
这意味着要解决抗生素耐药性问题
我们就真的需要以一个健康的理念来行动
为此 我们需要评估环境中的风险
以及环境是否对人类健康构成风险
环境可能会参与抗生素抗性传播
因为首先抗生素和抗性细菌
有着不同的来源
其中一个来源可能是生产抗生素的制造商。
但同时很显然 在医院
抗生素的选择性压力高于社区
当然你也可以在家里服用抗生素
农场也会使用抗生素
这些抗生素可能通过粪便和废水处理装置
被排放到河流中从而进入环境系统
这些不同的抗生素来源
25
可以导致抗性细菌的优胜劣汰
这之后 细胞就会在环境的不同部分传播
我们需要知道的就是这种环境污染
是否会对人类健康构成威胁
第一点是要知道是否存在可能的风险
是的 因为环境为抗体提供了一个巨大的的储备库
首先 抗性基因的种类十分繁多
例如β-内酰胺类，就有有数百种抗性基因。
遗传元件也具有高度多样性
它们能够传播抗生素抗性基因
细菌种类多种多样
在环境方面 只关注
废水处理厂就会发现多大3000种
而在土壤中则多达10000种细菌
你可以想象细菌之间传播的可能性有多大
问题是 如何评估这种风险呢
为此 我们需要生物标记物来跟踪抗性污染
尤其是在环境中
我们可以使用不同的标记细菌 基因 或遗传元件
我们将看到
不同方法的优势与劣势为何
第一个是寻找抗性细菌
这意味着一种依赖培养的方法
这种方法的优势在于它是一种表型方法
因此 你可以直接对细菌进行药敏试验
第二个是通过使用选择性培养基特异性
对那些至关重要的细菌进行检测
例如耐碳青霉烯的肠杆菌
或产生超广谱β-内酰胺酶的肠杆菌
我们已经在另外一章看到过
而且 这些方法使我们得以检测尚未知的
新的抗性机制
另一方面 缺点是
只有少数来自环境的细菌易于培养
大约只有1%
所以 可能在另外的99％里有着我们所不知道的
抗性基因或抗性细菌
而且也许这些细菌可能对人类健康造成威胁
已知对于碳青霉烯或ESBL的一些抗性机制
这些基因的祖细胞存在于环境中
也许我们还必须开发新的培植方法
另一种与培养无关的方法
是通过靶向方法 例如qPCR
以及使用新的测序方法的宏基因组方法来观察
具有这些基因的抗性基因或遗传元件
使用宏基因组方法
可以对光电元件有一个宏观的把握
这意味着样品中含有所有的抗性基因
而没有物种本身
这种方法的唯一劣势是你无法真正把
细菌和基因联系起来
例如 宏基因组方法的一个例子是如下研究
作者比较了河流流经一座城市前后
抗性基因的数量
比如有一座城市
他们会在经过城市之前和城市之后采样
这里 有不同的抗生素抗性基因
对氨基糖苷类氯霉素 β-内酰胺类
大环内酯类 磺胺类
四环素类和甲氧苄氨嘧啶类具有耐药性
然后这里发生了从4到10的折叠变化
这意味着经过城市之后比之前的
抗生素抗性基因增多了
针对遗传元件的方法的另一个例子
是使用整合子标记
整合子是在革兰氏阴性细菌中
对抗生素抗性起主要作用的遗传元件。
在另外一章可以看到
不同的团队 都把这些整合子
作为环境中人为污染的标记
进行了研究
在这图上 展现了丰富的临床环境
不同欧洲国家的医院和城市地区
覆盖从农场到河流
可以看到 与其他样本相比
医院富裕人群中整合子的比例存在差异
通过这个例子和前一个例子
我们可以说人类活动
对环境中抗性细菌和抗性基因的
传播产生了影响
但我们仍然不知道环境中的这种污染
是否真的对人类健康构成威胁
这意味着要澄清并真正评估这种风险
我们需要改进我们的量化方法
我们对指标的定义
对风险评估方法的定义
以及对人类系统中遗传转移的评估
最终 我们可以期待从源头上控制抗性细菌
这可以在维持抗生素治疗对人类健康的有效性方面
发挥作用
谢谢大家
-W1-0 Introduction of week 1
--Video
-W1.1 - Mode of action current section
--Video
--Q1
-W1.2 - Origin and biosynthesis
--Video
--Q2
-W1.3 - Impact on human health
--Video
--Q3
-W1.4 - Antibiotherapy
--Video
--Q4
-W1.5 - Veterinary usage
--Video
--Q5
-Weekly test 1
-W2-0 Introduction of week 2
--Video
-W2.1 - Resistance mechanisms
--Video
--W2.1 - Questions
-W2.2 - Antibacterial resistance in the community and the hospital
--Video
--W2.2 - Questions
-W2.3 - Epidemiology of bacterial resistance in Europe
--Video
-W2.3 - Questions
-W2.4 - Bacterial resistance in low and middle income countries
--Video
-W2.4 - Questions
-Weekly test 2
-W3-0 Introduction of week 3
--Video
-W3.1 - Phenotypic approaches
--Video
-W3.1 - Questions
-W3.2 - Genotypic approaches
--Video
-W3.2 - Questions
-W3.3 - In silico antibiogram: genomic approaches
--Video
-W3.3 - Questions
-W3.4 - Automated approaches current section
--Video
-W3.4 - Questions
-Weekly test 3
-W4-0 Introduction of week 4
--Video
-W4.1 - Natural versus acquired Resistance current section
--Video
--Q4.1
-W4.2 - Origin of resistance genes current section
--Video
--Q4.2
-W4.3 - Role of the environment
--Video
--Q4.3
-W4.4 - Transferability of resistance genes
--Video
--Q4.4
-W4.5 - Evolution of bacterial populations
--Video
--Q4.5
-Weekly test 4
-W5-0 Introduction of week 5
--Video
-W5.1 - Antibiotics stewardship
--Video
--Q5.1
-W5.2 - Mastering resistance in hospitals current section
--Video
--Q5.2
-W5.3 - Economic cost of ABR current section
--Video
--Q5.3
-W5.4 - Social consequences of bacterial resistance current section
--Video
--Q5.4
-Weekly test 5
-W6-0 Introduction of week 6
--Video
-W6.1 - Revisiting "old" molecules current section
--Video
--Q6.1
-W6.2 - New targets : from leads to candidate
--Video
--Q6.2
-Q6.3
-W6.4 - Phagotherapy
--Video
-Q6.4
-W6.5 - CRISPR tools to study and fight antibiotic resistance
--Video
--Q6.5
-Weekly test 6