生物大数据

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生物大数据视频慕课课程简介：

生物大数据所蕴含的巨大潜在价值使其备受关注。本课程起源于大数据的发展，衍生自生物信息学课程，专注讲授生物大数据的产生、分析与应用。“生物大数据”课程组期望通过在线课程方式，从生物学大数据的概念与来源、生物学大数据分析与应用、案例分析等多个方面，系统展现课程内容。

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生物大数据课程列表：

第一章 导论

-第一节 大数据时代的特征

--视频 I ：大数据的概念

--视频II ：大数据的特征

--视频III ：大数据的应用

--视频IV ：大数据对人类的挑战

-第一节 大数据时代的特征--作业

第二章 基因组测序

-第一节 基因组测序技术简介

--视频 I：一代测序技术

--视频II ：一代测序技术的缺陷

--视频III ：二代测序技术

--视频IV ：二代测序技术的缺陷

--视频 V ：三代测序技术

--视频VI ：三代测序技术的应用与缺陷

-第一节 基因组测序技术简介--作业

-第二节 基因组测序方式与质量控制

--视频 I ：基因组测序方式I--单端测序+双端测序

--视频II：基因组测序方式II—配对测序

--视频III：基因组测序方式III—测序方式优劣比较

--视频IV：基因组测序读段的记录格式

--视频 V ：基因组测序读段质量的控制

-第三节 基因组denovo组装与注释

--视频 I：基因组de novo组装的常用工具I

--视频II：基因组de novo组装的常用工具II

--视频III: 基因组组装的空格填充方法I

--视频IV：基因组组装的空格填充方法II

--视频 V：基因组组装的质量评价

-第四节 基因组Reference组装与分析

--视频 I：基因组重测序的概念与应用

--视频II：基因组变异类型与检测I

--视频III：基因组变异类型与检测II

--视频IV：基因组重测序序列组装

--视频V: 案例分析--植物基因组组装

--视频VI: 案例分析--个人基因组应用

第三章 基因组重测序技术的应用

-第一节 基因组重测序技术

--视频I：全基因组的从头测序

--视频II：全基因组重测序数据分析

-第二节 全基因组重测序技术的应用

--视频I: 基因组重测序技术在育种中的应用

--视频II: 基因组重测序技术在检测中的应用

第四章 宏基因组测序与分析

-第一节 宏基因组测序技术

--视频I：宏基因组的概念及应用

--视频II: 宏基因组测序的目的与分析策略

-第二节 宏基因组测序数据分析

--视频I: 微生物菌群对人类健康的影响

--视频II：利用宏基因组分析菌群多样性

--视频III: 案例分析

第五章 转录组测序与分析

-第一节 转录组测序

--视频I：转录组测序简介及其优势

--视频II：转录组测序的流程

-第二节 转录组测序数据分析

--视频I： 转录组测序数据分析流程及工具

--视频II：转录组测序数据分析结果

--视频III: 案例分析

第六章 生物学分子数据库

-第一节 DNA数据库

-- DNA序列数据库I

-- DNA序列数据库II

--数据库应用案例—NCBI数据库I

-- 数据库应用案例—NCBI数据库II

-第二节 蛋白质数据库

--蛋白质数据库概览

--蛋白质序列数据库

--蛋白质模式数据库

--蛋白质结构数据库

--蛋白质分类数据库

生物大数据开设学校：福建农林大学

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