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PubMed结果处理

下一节:引文检索基础知识

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PubMed结果处理课程教案、知识点、字幕

大家好

我是中南大学

信息安全与大数据研究院的黄碧云老师

本节知识点介绍的是PubMed结果处理

这是PubMed检索出来的题录信息

你能读懂吗

第一项是篇名

第二项是作者

第三项是出处

出处还包括刊名 年卷期页码

这里12是卷

1是期

此外PubMed还提供DOI

PubMed的题录信息

有时候还提供全文链接

比如说这里是Free PMC Article

点击这个链接

可以获取来自PubMed Central的免费全文

下面我们再看这一条题录信息的其他细节

作者采用一种特定的格式

姓在前用全称

名在后用首字母缩写

反过来检索的话

我们也可以用这样的格式

姓在前用全称

名在后用首字母缩写

限定在au字段

同名同姓如何区分

我们可以通过机构

限定在ad字段

同一个机构还存在同名同姓的现象

在这种情况下

我们可以通过具体科室进行区分

限定在ad字段

在这里我们看到刊名是采用标准缩写的形式

当我们的鼠标悬在刊名缩写的地方

刊名的全称就能够显示出来

刚刚我们看到了刊名的标准缩写

刊名的全称

期刊的其他信息怎么去获取呢

我们可以利用Journals in NCBI Databases

在PubMed主页点击

Journals in NCBI Databases这个超链

可以进入Journals in NCBI Databases

来获取期刊的更多详细信息

怎么进行检索呢

检索我们也可以利用

Journals in NCBI Databases

除此之外

我们还可以利用期刊的ISSN号

可以利用刊名的缩写

限定在ta字段

也可以利用刊名的全称

限定在ta字段

如果利用高级检索

我们可以通过

下拉式菜单选择Journal来实现

PubMed还提供DOI号

DOI的全称

Digital Object Identifier

数字对象标识符

它的特点是具有唯一性和持久性

我们可以利用网站

dx.doi.org进行解析

如何看到PubMed的详细信息

如何输出检索结果

PubMed检索结果的详细信息

我们可以利用Summary这里的

下拉菜单来实现

将检索结果输出

我们可以利用Send to来实现

这里是我们点击Summary之后

看到的下拉式菜单

在这个下拉菜单里面

我们可以选择Abstract

Abstract text

MEDLINE

这三种详细的记录格式

推荐的是Abstract

这里我们看到的就是

PubMed Abstract的格式

在这里我们可以看到刊名有个超链

点击可以进行检索

另外作者项也是超链的形式

点击可以进行检索

PubMed的Abstract格式

还提供Author information

如果有文摘的话

还可以看到它的文摘

另外有时候还会有全文的图标

点击这些图标可以进一步去获取全文

如何输出

在这里Send to有个下拉式菜单

点击之后弹出一个窗口

第一个选项

File

是将文献的检索结果以文件的形式保存

Collections

注册了My NCBI账号的用户

可以将检索结果发送到Collections

供以后调用

Order订购全文

这是一种付费的文献传递服务

Citation manager

将检索结果保存在文献管理软件中

Clipboard

将多次的检索结果存储在Clipboard中

然后再集中输出

我们也可以将检索结果发送到指定的Email

此外注册了My NCBI账号的用户

也可以选择Bibliography供以后调用

推荐的方式是File和Citation manager

比如说这里我们看到的是

选择File这个选项之后看到的页面

选择File之后

在这里会有一个Format格式的选择

选择好之后再点击Create File

执行

检索结果过少如何处理

可以去掉多余的检索词

比如说将课题中不重要的检索词去掉

比如说我们可以去掉文献类型

和时间方面的检索词

此外我们也可以采用增加同义词的方式

另外我们还可以利用Similar Articles

这里我们看到的是PubMed的一条检索结果

点击下方的Similar Articles

可以获得这篇文献的相似文献集

这是点击Similar Articles超链之后

返回的相似文献集

总共有101篇相似的文献

相似文献的计算它是采用单词加权算法

比较文献的标题 文摘和主题词

所以在整个数据库中

与我们选定的文章最相似的文献是它本身

在这101篇相似文献中

返回的第一篇就是我们所选定的文章

检索结果过多如何处理

用专指词代替宽泛的词

比如说我要查找碳纳米管在癌症领域的应用

癌症这是比较宽泛的词

我们可以用专指词

比如说乳腺癌

大肠癌来代替宽泛的词癌症

也可以采用增加检索词的方式

碳纳米管在癌症领域的应用

两个概念

一个是碳纳米管

另外一个是癌症

我们还可以增加第三个概念

第四个概念

再将这些概念通过AND的方式连接在一起

此外我们也可以采用精确或限定字段等技术

比如说碳纳米管打引号

这是精确检索

也可以将碳纳米管限定在ti

文献的篇名字段当中进行检索

碳纳米管限定在MH医学主题词字段进行检索

采用精确或限定字段等技术

关闭了PubMed最强大的功能

自动词语匹配

另外我们还可以利用Filters来实现

本节知识点介绍到这里

谢谢大家

医学文献检索课程列表:

第一章 绪论

-第1节 信息检索涵义

--信息检索涵义

-第2节 学习信息检索的意义

--学习信息检索的意义

-第3节 如何分析检索课题

--如何分析检索课题

-第4节 如何选择合适的数据库

--如何选择合适的数据库

-第5节 如何选用恰当的检索词构建检索表达式

--如何选用恰当的检索词构建检索表达式

-第6节 如何有效利用搜索引擎

--如何有效利用搜索引擎

-第一章测试题

第二章 中文医学文献数据库检索

-第1节 中文医学数据库检索概述

--中文医学数据库检索概述

-第2节 中国知网

--中国知网

-第3节 万方数据

--万方数据

-第4节 维普资源

--维普资源

-第5节 中国生物医学文献服务系统

--中国生物医学文献服务系统

-第二章测试题

第三章 PubMed

-第1节 PubMed与MEDLINE概述

--PubMed与MEDLINE

-第2节 PubMed检索方式

--PubMed检索方式

-第3节 PubMed基本检索

--PubMed基本检索

-第4节 PubMed结果处理

--PubMed结果处理

-第三章测试题

第四章 引文检索

-第1节 引文检索基础知识

--引文检索基础知识

-第2节 引文检索的作用——独特的文献检索

--引文检索的作用——独特的文献检索

-第3节 引文检索的作用——评价作用

--引文检索的作用——评价作用

-第4节 Web of Science核心合集检索

--Web of Science核心合集检索

-第5节 中文引文检索

--中文引文检索

-第四章测试题

第五章 参考文献选择与著录

-第1节 参考文献作用与选择

--参考文献作用与选择

-第2节 参考文献标注体系与著录项目

--参考文献标注体系与著录项目

-第3节 图书与期刊著录

--图书与期刊著录

-第4节 中国专利文献著录

--中国专利文献著录

-第5节 美国专利文献著录

--美国专利文献著录

-第6节 其它特种参考文献著录

--其它特种参考文献著录

-第五章测试题

PubMed结果处理笔记与讨论

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