当前课程知识点:医学文献检索 > 第一章 绪论 > 第1节 信息检索涵义 > 信息检索涵义
大家好
本次知识点主要介绍信息检索的含义
什么是信息检索
那么我首先从霍普金斯悲剧谈起
霍普金斯的悲剧是在美国著名的研究型大学
霍普金斯大学所发生的医学实验致死事件
我们都知道霍普金斯大学是国际上著名的
研究型的大学
那么它在全美排在前十左右
在世界上排在前15位左右
它创立于1876年
它的获得诺贝尔奖的科学家有37位
所以这个大学非常著名
但霍普金斯悲剧是怎么产生的呢
就是2001年约翰霍普金斯大学的一个
Alkis Togias博士
进行了一项哮喘的超敏反应的医学试验
旨在探索哮喘病人肺部
对刺激物的反应方式
他也采用了招募正常的志愿者来进行试验
所以Roche也参与了试验
这个试验就是吸入一种六甲铵的药物
但是参加试验的Roche 年仅24岁
她吸入这个六甲铵以后
出现了咳嗽和呼吸急促等症状
几周以后,她的肺功能衰竭,进而肾脏衰竭
于2001年6月2日 Roche死亡
这个事件在国际上产生了重要的影响
那么这个事件是怎么发生的呢?
它的根源就是源于不恰当的信息检索
那么在美国的联邦人类研究保护办公室
经过核查,得出以下结论
就是霍普金斯这个博士没有发现
六甲铵跟肺毒性之间的联系
即使采用了常规的Internet网的信息检索
和教科书等等方面的这个检索
但是没有发现他们的联系
那么他的检索我们可以看看当时是怎么发生的
它的内部的调查报告就详细地描述了PI Togias
他所使用的信息的检索技术
第一个他也采用了这个教科书的检索
像在肺部和药理毒性方面
最有名的这个教科书是Goodman & Gilman’s
治疗学的药理学基础以及
Fishman’s Pulmonary Diseases and Disorders
就是Fishman’s肺病的一本教科书
在最新的教科书里面都没有提到这个毒性
但是较老的Fishman’s教科书里面
提到了这个毒性
因为知识的更新,所以就没有提到这种毒性
他就没有找到其中的联系
那么他也同时进行了PubMed的检索
我们大家都知道PubMed
是国际上最有名的医学文献数据库
他采用了各种各样的检索策略
像他采用了六甲铵吸入肺的损伤没有找到一篇文献
同时也采用六甲铵吸入来查找得到了42篇文献
但是真正的文献里没有提到这个肺的毒性
他也用六甲铵和肺也检索得到了三篇有用的文献
但是他没有深入的利用这些文献
另外一个他采用肺
采用六甲铵和肺毒性找到了四篇文献
但是他认为这个没有用
他也采用了六甲铵跟肺的超敏反应
他得到了16篇文献但是有三篇是有用的
他同时也采用了这个六甲铵跟肺纤维化
得到了三篇文献 两篇有用
但是他可能在这个应用的过程中
没有找到很好的它们联系
同时他也利用了Internet检索
当时他也采用了google检索,Yahoo检索
查找肺方面的文献以及
也采用了LookSmart和goto
另外一个在化学药物方面的一个最权威的数据库
这是Micromedex但是它有肺的毒性
作为这个六甲铵首选的副作用
所以说但是他没有很好的注意起来
没有把它利用起来
那么作为图书馆员能不能够来预防霍普金斯悲剧
那么我们可以从以下几个方面来考虑
第一个是手检我们的教科书或者医学索引Index Medicus
它包括以前的发表在二十世纪50年代的文献
第二他可以检索OldMedline
以及更老的Medline版本
包括以前的文献 像Medscape
可以回溯到1960年
他可以检索pubmed
使用这个主题词
我们都知道主题词在不同的时间他是经过有变化的
所以我们在1995年时候
我们可以采用六甲铵的这个主题词
可以进行检索
1995年以前的我们可以采用什么来检索
就是这个补充化学物质的这个词
以及在1980年以前
可以采用它的这个复合物来进行检索
我们还可以跟图书馆员检索Micromedex Poison Index
毒力学管理方面的数据库
有关于神经节阻滞剂等方面的文献
它里面就包括了1950年以前的讲到了六甲铵的危险性
然后我们还可以利用专业的查找
化学来源的数据库
这其中就包括了六甲铵的各种表现形式
像溴化六甲铵以及
在六甲铵其他的公司的名称、地址、电话号码、传真号码等等
我们来获取这方面的资源
Welch Medical Library是霍普金斯的医学图书馆
他们就果断的采取了措施
建立了学科馆员的服务
我在霍普金斯做访问学者的时候
他们的这些信息专员就专门跟不同的科室
进行一对一的信息服务
并且他们也开展了信息检索方面的培训
来指导医学文献的检索
什么是信息检索
信息检索 广义上来讲
包括信息的存储和信息的检索两个过程
信息的存储是后台工作人员把他们整理归类收集起来
根据信息的形式的特征和内容的特征
经过整理、分类、浓缩标引等处理使其系统化、有序化
按照一定的技术要求组建成一个具有检索功能的
检索工具或者检索系统
信息检索狭义来讲是根据用户的信息需求
运用编制好的检索工具和检索系统
找出用户需要的特定信息的一个过程
对于我们一般的用户来讲
我们一般从狭义的角度来进行理解
在这个定义中包括了三个重要的概念
一个你的信息需求是什么
你的检索工具和检索系统是什么
你的特定的需要是什么
就是我们需要解决这个三个方面的核心的概念
特定的需要
根据我们的目的不同
我们的需求就不一样
我们的需求是驱使我们进行信息检索的
一个很重要的内在的驱动力
像我们求学求知的需要
是要获取新的知识
我们来读本科然后读硕士
将来毕业以后到工作岗位上面要获取新的知识
所以说这个是我们获取新的知识的需要
当然我们在读研究生的期间
要完成我们的学位论文
这个时候就必须要查阅大量的文献
撰写我们自己的论文
另外一个就是知识的更新的需要
第二是科研的诉求
我们作为一个科研人员
特别是作为一个临床的科研人员
我们要提高自己的这个临床技能
我们就必须要申报科研项目
进行科学研究
我们做研究生的期间
我们要进行撰写硕士学位论文
我们的学位论文必须要进行选题
在这个选题的过程中
我们要利用信息检索查出所需要的文献
但是我们的文献写的这个文章
那么要发表我们就要找到要发表的期刊等等方面
就是在科研中要利用我们的信息检索
在日常的这个问题当中衣食住行等等方面
都需要我们的信息检索
第二个概念就是信息检索工具和检索系统
从分类来讲
这个检索工具既包括手工的检索工具
像一些目录和索引和文摘等等
现在一般印刷型的工具我们当然选择检索
现在来讲的话我们都是利用学术专业方面的数据库
像中国知网、SinoMed、 PubMed、 WOS等等
这些专业的数据库
另外也可以获取日常的信息
可以利用搜索引擎,像百度、bing、Google等等
这些重要的搜索引擎来解决日常的这些问题
另外一个,计算机信息检索系统
从它的逻辑视图来看
包括这个几个方面:一个是用户的界面
用户的界面就是我们进行输入查询式
和文档输出相关反馈的结果可视化的界面
第二个,就是我们的文本操作
文本操作涉及到两个方面
一个就是我们的这个文档的文本操作
还有用户的需求我们要进行文本操作
这个文本操作的话涉及到分词
以及删除停用词
还有一个就是我们要进行提取词干,对文本进行操作
第三个步骤 就是查询
查询的操作就是对我们的题问式进行转换
然后能够使结果更加符合我们的需要
在这个文档进行管理的时候,对文档要进行
建立倒排档,使我们的检索加快
搜索就是根据这个倒排档中索引
检出与我们的检索提问相关的文档
然后检索结果进行排序输出
就是将我们的检出来结果,根据它们的相关性进行排序输出
然后反馈给我们检索的用户
第三个概念就是特定的信息
这个跟我们检索的需求,跟我们信息的需求又是相一致的
我们要需要某一个特定的内容
在进行检索上
我们就要根据这个内容提取关键词来进行检索
这个是我们国家的一个基金项目熊伟教授的
他里面就讲到了
鼻咽癌中P53蛋白聚集的分子机制研究
这里面就写到了几个概念
第一个是鼻咽癌,第二个是P53蛋白,还有一个是聚集
还有它的这个分子机制
我们在检索的时候,就这些核心的概念我们要进行分词
要提取它的检索词
第二个就是特定的作者
跟作者的检索是有关系的
像我们检索周宏灏院士发表的论文
以及他的论文被引用情况等等
第三个是特定的国家和机构
所以要了解我们国家在国际上的科研的状况
以及了解我们中南大学湘雅医学院
湘雅医院等等在国内的一个情况
那么我们可以通过作者机构的检索
另外一个还可以特定文献的类型
像我们假如检索其他方面的文献,要检索专利
我们在写论文的时候,要检索学位论文方面的文献等等
本知识点讲到这里
谢谢大家
-第1节 信息检索涵义
--信息检索涵义
-第2节 学习信息检索的意义
-第3节 如何分析检索课题
--如何分析检索课题
-第4节 如何选择合适的数据库
-第5节 如何选用恰当的检索词构建检索表达式
-第6节 如何有效利用搜索引擎
-第一章测试题
-第1节 中文医学数据库检索概述
-第2节 中国知网
--中国知网
-第3节 万方数据
--万方数据
-第4节 维普资源
--维普资源
-第5节 中国生物医学文献服务系统
-第二章测试题
-第1节 PubMed与MEDLINE概述
-第2节 PubMed检索方式
-第3节 PubMed基本检索
-第4节 PubMed结果处理
-第三章测试题
-第1节 引文检索基础知识
--引文检索基础知识
-第2节 引文检索的作用——独特的文献检索
-第3节 引文检索的作用——评价作用
-第4节 Web of Science核心合集检索
-第5节 中文引文检索
--中文引文检索
-第四章测试题
-第1节 参考文献作用与选择
-第2节 参考文献标注体系与著录项目
-第3节 图书与期刊著录
--图书与期刊著录
-第4节 中国专利文献著录
--中国专利文献著录
-第5节 美国专利文献著录
--美国专利文献著录
-第6节 其它特种参考文献著录
-第五章测试题