当前课程知识点:蛋白质表达纯化与功能研究 > 纯化策略及扩展应用 > 3.7 膜蛋白 > 3.7.2
我们下面将通过三个实例
具体展示出
膜蛋白的表达和纯化
接下来讲第一个实例
这个实例是纯化
兔热病杆菌的膜蛋白CapA
论文的作者推测
CapA是一个
涉及多糖合成的聚合酶合酶
首先
作者将CapA基因
构造到含T7启动子的
pRSET质粒上
并与GFP基因融合
然后
作者将带有融合基因的pRSET质粒
转化到大肠杆菌菌株
BL21(DE3)pLysS
在TB培养基中培养
CapA蛋白通过
1mM IPTG诱导表达
在20摄氏度培养过夜
然后
在4摄氏度离心收集菌体
菌体超声破碎后
通过超速离心收集膜组分
并洗杂一次
接下来
作者通过去垢剂筛选实验来寻找
萃取效率高
且能够稳定该蛋白的去垢剂
首先
作者将待测去垢剂用水
配置成20倍CMC的母液
然后加入到悬浮了膜组分的
溶液中
各去垢剂的浓度
如表所示
膜与去垢剂在4摄氏度
孵育45分钟
然后超速离心去沉淀
上清通过western blot
以及荧光吸收
计算融合蛋白的萃取效率
结果显示
各去垢剂萃取效果都不错
其中
DDM和DM更好
作者进一步用
镍柱亲和层析回收
融合蛋白
亲和层析前
镍柱用含有去垢剂的溶液平衡
所用的去垢剂种类
和浓度如此处所示
需要注意的是
去垢剂浓度一般
控制在1.5倍CMC以上
但低于从
生物膜萃取蛋白所需的去垢剂浓度
为减少融合蛋白与镍柱的非特异性结合
结合液里含有20mM咪唑
洗杂液里含有50mM咪唑
洗脱液含有500mM咪唑
洗杂液和洗脱液都是10倍柱体积
这里
我们用SDS-PAGE银染结果
展示膜融合蛋白
在去垢剂
DM中的
亲和纯化结果
大家可以看到
融合蛋白主要在第4到6个柱体积
被洗脱出来
亲和层析回收的融合蛋白
进一步用凝胶过滤层析纯化
纯化结果如图所示
大家可以注意到
融合蛋白在不同的去垢剂中
表现出不同的寡聚态
譬如
在含DDM的溶液中
融合蛋白以十二聚体存在
在含DM
以及Cymal-6的溶液中
以五聚体存在
而在含CHAPS的溶液中
融合蛋白以四聚体存在
上述结果提示
去垢剂的种类和性质
是膜蛋白
结构与功能研究的重要变量
实例二
以Gamma secretase为例
展示真核膜蛋白复合物的纯化
这里展示的是
施一公实验室的工作
Gamma secretase
是跨膜的
蛋白酶复合物
包含四个亚基
分别是nicastrin
presenilin
APH-1
和Pen-2
Gammasecretase
在膜内剪切单次跨膜蛋白
促进这些蛋白的成熟
一些重要的单次跨膜蛋白
譬如
Amyloid precursor protein
CD44 Notch
都是Gamma secretase的底物
Gamma secretase的表达困难
一直阻碍了其结构的研究
施一公实验室构建了个性化的
质粒pMLink
将Gamma secretase
四个亚基的基因
分别置于独立的启动子控制下
通过瞬时转染
HEK293细胞
解决了Gamma secretase的表达难题
该蛋白利用去垢剂 CHAPSO萃取
用Anti-Flag亲和柱纯化
最后通过Superose 6
进行凝胶过滤层析
获得高纯的蛋白样品
更多的细节请学员们查阅相关的文献
这张幻灯片显示的是
gamma secretase
凝胶过滤层析的结果
gamma secretase的
理论分子量
大概在230 kDa左右
这里显示的表观分子量
在440 kDa以上
产生这种差异的原因主要有两点
首先
凝胶过滤层析显示的
膜蛋白颗粒尺寸
通常是蛋白
去垢剂 脂的复合物尺寸
所以比单纯的蛋白颗粒大
其次
gamma secretase
有翻译后修饰
最后的一个实例
是从天然组织猪心中
获得线粒体呼吸链复合物Ⅱ
线粒体呼吸链复合物Ⅱ
是琥珀酸脱氢酶
含有一个 FAD
一个铁硫蛋白
和一个血红素 b
复合物II的作用是催化电子从
琥珀酸转移至
辅酶 Q
这里展示的是饶子和实验室
提取线粒体呼吸链复合物的研究
该工作为从天然组织提取膜蛋白
提供了一个很好的样板
从天然组织中
提取特定膜蛋白的前提
是目标蛋白的丰度要高
因为不像异源表达
天然组织通常成分复杂
且目标蛋白难以通过
亲和层析来富集
线粒体是真核细胞
主要的能量供应单位
代谢功能旺盛的组织细胞
像心肌细胞和肾脏细胞等
有大量的线粒体
这些细胞为提取
呼吸链复合物II
提供了良好的物质基础
线粒体呼吸链复合物II的
纯化的简要流程如下
首先
将心肌组织分离和破碎
低速离心去除固体组织
然后对上清高速离心
富集包含线粒体的沉淀物
沉淀物用溶液重悬后
超速离心获得膜组分
然后
呼吸链复合物I-IV的混合物
用胆酸钠萃取
最终
呼吸链复合物II
通过硫酸铵梯度沉淀
和胆酸钠萃取的方法获得
目标蛋白样品中残留的硫酸铵
和胆酸钠通过透析除去
天然提取的呼吸链复合物II
晶体结构分辨率达2.4埃
它与抑制剂
nitropropionate
和TTFA复合物的晶体结构
分辨率也有3.5埃
最后
我们对膜蛋白纯化的要点进行总结
一 选择合适的表达体系
提高膜蛋白的表达量
二 选择最优的去垢剂
提高膜蛋白的萃取量
三 添加适当的脂类维持膜蛋白活性
到此
本节课程的所有内容讲解完毕
谢谢大家
-总论
-总论
-第一章
-第一章
-2.1 蛋白质表达策略
-2.2 蛋白质电泳与免疫印迹
-第二章测试
-3.1 凝胶过滤层析
-3.2 亲和层析
--3.2 亲和层析
-3.3 离子交换层析
-3.4 ÄKTA实验操作
--3.4
-3.5 疏水层析
--3.5
-3.6 多模式层析技术
--3.6
-3.7 膜蛋白
--3.7.1
--3.7.2
-3.8 病毒
--3.8 病毒
-3.9 水溶性蛋白
-第三章测试
-4.1蛋白相互作用技术及应用
--4.1.1
--4.1.2
-4.2 Biacore实验设计和操作
--4.2.1
--4.2.2
--第四章测试
-结束
-结束