当前课程知识点:计算化学 > 第二章:几何构型的优化方法和技巧 > §5. 内禀反应坐标(IRC)的计算 > IRC的基本理论
同学们
今天我们要来讲内禀反应坐标
IRC的基本理论
IRC是市面上的能量最少途径
那么怎么来理解这种能量最少途径呢
我们可以举一个例子
这是我们在2000年的时候做的
氢原子和水分子反应
生成氢气和OH的这么一个反应
那么像这样的一种反应
他在生态面里面
如果从反应物到产物的话
它中间会经过一个
柏罗钛的位置
那么这里是我们
要的反应物的这个区域
然后这是一个产物的一个区域
像这样的一个途径
如果在这里面
我们只是画出来三个点
那么实际上在这个反应里面
它实现从起始物到产物
可以有不同的途径
比如说可以这个图里面
对象的一个位置
也可以
我们从这个地方
到这然后到到这一个位置都可以
在这里面
我们所谓的能量最少途径
实际上就等于是
需要沿着我们刚才图里面这个
虚线的这个位置来求解
像这样的一个途径
在这里面每一个点的坐标
如何来求解呢
这是我们今天要讲
IRC的这个求解方程
为了求解它
我们就假设N个原则体系的话
我们把每一个原子的运动
看做是一个质点的运动
这样的话
我们就可以遵拉格朗日方程
在这个方程里面
我们可以定义第一部分
是一个广义速度部分
那么后面这项
是广义坐标的部分
我们就可以知道每一个原子的运动
但是在这里面还有像L这个量
来定义我们
每一个原子运动的能量变化过程
这个L我们就可以定义成
动能部分和势能部分
有了这个以后
这个L我们如果带入到
前面这个公式里面的话
我们就可以得到
真正的IRC的一个方程
像这样的一个方程
实际上我们现在
还没有办法来求解
这里面主要是
这个方程里面跟时间有关
所以我们还需要引入一个假设
这个假设是什么呢
福井在70年代就提出来
假设每一个原子的运动
是一个浮现缓慢的话
那么这个广义速度
它就会变成是等于0了
那么这种假设应该还是合理的
因为相对于电子的运动来说
每个原子核运动是无限缓慢的
所以这个假设
应该还是相对合理的东西
有了这种假设的话
我们刚才这个方程里面
跟时间有关的这一项
其实就已经没有了
所以说我们就变成了分子是这一项
分母是原来的
因为左边有两项
那么我们两项比例
就变成是一个常量
就跟时间无关了
这里面要注意的是
坐标是从第一个坐标
一直可以到N个坐标
这N个坐标
就取决于你这个体系里面原子数目
像这样的一个方程
我们就变得比较简单了
这个坐标实际上
有很多种定义的方式
而我们做IRC的话
一般来说
我们用这个直角坐标体系来处理
比较简单
在这里面
动能部分是这样的一种形式
动能里面就我们多了一项
mi是每一个原子的质量
刚才这个方程里面
我们就引入了一个质量
那么这个质量这一项
是比较复杂的
如果直接搁在里面的话
这个方程也还是没有办法
直接来求解
我们要把这个mi改拆分开来
可以拆成是根号mi
乘上根号mi一旦分开以后的话
我可以把
其中一个mi可以移到
这个xi里头去
另外一个根号mi可以移到
它这个分母上去
这样的话这个mi
就没有直接出现了
已经引入了这个坐标里面去了
有了这种处理以后
我们这个坐标就会变成
是一个质量权重的一个坐标体系
那么
我们可以假设
这个X’是等于
根号mi乘上xi
所以这个方程就会处理成
底下这种形式
这个方程就比刚才简单了
因为没有了一个
质量有关的一个东西
因为质量有关
已经引入了我们这个坐标里头去了
那么即使这样处理以后
这个方程
其实还没有办法来直接求解
所以为了求解他的话
IRC的实际计算里面
就Morokuma在77年提出来
这个方程
我们引入了一个S这个量
这S是一个反应坐标
这里面这个
XIRC是我们要做的要处理的东西
实际上是体系的这个几何贡献
然后这个gk是能量对坐标的
一级导数也就是梯度
在上面这个方程
实际上这是一个微分方程
这个方程没有办法直接做
所以我们还需要引入一个近似
就把上面这个东西
我们并认是一个差值的一个形式
那么像这样一种处理以后
比如K+1
这是K
如果我知道这K点的这个坐标的话
我需要求出来
K+1点这个坐标
它需要做的是什么呢
就有了这个K点的坐标的话
我就可以求出来gk这里的能量
那么右边这一项是
已知的值
有了这个以后
那么我把原来这个坐标
这一项移到右边来的话
我就可以算出来
它下一点呢这个坐标
所以这个IRC方程
就变成是一个简单
可以求解的一个方程
来看一下
这个实际的一个过程
实际要求解的话
我们要从这个
过渡态这个点坐标开始
那么我们要求下一点的坐标的话
就需要根据刚才这个方程
我们就可以直接来做这个东西
但是在这里面就由于
过渡态这个点能量对坐标求导数
它是等于0
所以实际上这个点
我们还是没有办法
往下移到下一个点里面
所以实际求解的时候
我们还需要做进一步的处理
处理的办法是
如何离开过渡态就第一步
我们按照过渡态的
这个虚震动模式的方向来离开
在这里面一般取了不尝试
0.1个bohr
根号M又来做这个实际处理
一旦离开以后
这个gk就不等于0了
所以一旦gk不等于0的话
这个方程就可以解了
如果一旦知道
sk这点坐标的话
然后我可以求出来
这个gk这个值
那么我就可以算出来
它这个下一点的这个坐标
那么整个沿着IRC的这个反应过程
我们都可以求出来了
这就是我们讲了
基本的IRC的一个方程
那么具体的
你们可以下去
回去看看这个参考文献
这是我今天讲的主要内容
谢谢大家
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