当前课程知识点:临床科研实验技能 > 第五章 临床科研中常用数据库和软件使用 > 5.4 常用数据库和软件使用 > 5.4.5 变异查询
同学 你好
这一部分我们学习的是
NCBI SNP数据库基因变异的查询
dbSNP
单核苷酸多态性数据库
包括单核苷酸多态性(SNP)
和小型变异如插入/缺失
微卫星和非多态性变异
通过打开浏览器搜索NCBI SNP
进入NCBI SNP数据库主页
也可通过打开浏览器搜索NCBI
进入NCBI主页
点击进入NCBI主页后
点击All Databases
选择SNP数据库
在SNP数据库中对一个基因的所有收录变异查询
是通过输入基因名和物种信息进行
如输入GJA3 homo
点击基因名后括号内的GeneView链接
进入基因的SNP数据库界面
SNP数据库中默认显示为编码区的变异
即cSNP
通过选择in gene region
点击refresh
可以显示整个基因的变异信息
基因不同区域如3'非编码区(UTR)
编码区和内含子区的变异用不同颜色显示
而编码区的变异
不同类型的变异显示颜色也不同
如果已知某变异的rs号
则可以直接通过输入rs号
如rs398122937进行查询
直接点击搜索结果中的rs398122937链接
进入页面查看SNP数据库中该变异的详细情况
数据库中变异详细信息中包含变异的HGVS规范命名
ClinVar库中收录的临床意义
不同转录本氨基酸改变情况和人群中频率信息等
好了 这一部分的内容我们就学习到这里了
-1.1 临床科研实验简介
-1.2 医学实验中心基本情况
-1.3 进室流程和管理制度
-1.4 实验总结要点和实验心得
-第1章 习题作业
--第1章 习题作业
-第一章 课件
--第一章 课件
-2.1 科研诚信问题
-2.2 科研诚信与学术规范
-2.3 杜绝科研不端行为
-第2章 习题作业
--第2章 习题作业
-第二章 课件
--第二章 课件
-3.1 分子生物学常用实验技术
-3.2 PCR技术
-3.3 电泳技术
-3.4 蛋白质印迹技术
-第3章 习题作业
--第3章 习题作业
-第三章 课件
--第三章 课件
-4.1 精准医学概述
-4.2 常见遗传病简介
-4.3 精准医学在遗传病中的应用
-第4章 习题作业
--第4章 习题作业
-第四章 课件
--第四章 课件
-5.1 生物信息学概述
-5.2 常用生物信息学数据库
-5.3 常用生物信息学分析工具
-5.4 常用数据库和软件使用
-第5章 习题作业
--第5章 习题作业
-第五章 课件
--第五章 课件
-6.1 细胞培养基本概念
-6.2 细胞培养基本条件
-6.3 细胞培养基本方法
-6.4 细胞培养操作流程
-6.5 细胞冻存、复苏和污染检测
-第6章 习题作业
--第6章 习题作业
-第六章 课件
--第六章 课件
-7.1 细胞凋亡概述
-7.2 细胞凋亡分子机制
-7.3 细胞凋亡的检测
-7.4 细胞凋亡与疾病
-第7章 习题作业
--第7章 习题作业
-第七章 课件
--第七章 课件
-8.1 动物实验设计与应用
-8.2 实验动物分类与选择
-8.3 医学动物实验模型
-8.4 实验动物的伦理与福利
-第8章 习题作业
--第8章 习题作业
-第八章 课件
--第八章 课件
-9.1 免疫组化技术
-9.2 免疫荧光技术
-9.3 酶联免疫吸附技术
-第9章 习题作业
--第9章 习题作业
-第九章 课件
--第九章 课件
-10.1 SCI论文基本知识
-10.2 SCI论文写作
-10.3 SCI论文撰写技巧
-10.4 SCI论文投稿和发表
-第10章 习题作业
--第10章 习题作业
-第十章 课件
--第十章 课件