当前课程知识点:分子生物学 > 第十一章 常用组学研究 > 第2节 转录组学 > 转录组学
大家好
我是来自中南大学湘雅三医院的袁腊梅
这一章我们学习的内容是常用组学研究
这一节的知识点是转录组学
首先我们从转录 转录组和转录组学三个概念学习
转录是指生物体以DNA为模板
合成RNA的过程
即将DNA的脱氧核糖核苷酸序列
转抄成RNA分子的核糖核苷酸序列
是基因表达的一部分
转录的初级产物为RNA前体
经一系列加工和修饰成为成熟RNA分子
表现出其生物学功能
转录组是指生命单元
所能转录出来的全部转录本
包括信使RNA 核糖体RNA 转运RNA和其他非编码RNA
转录组学是在整体水平研究细胞内编码基因的
转录情况及转录调控规律的科学
其特点是转录组受到
内外多种因素的调节 是动态可变的
它可揭示不同物种 不同个体 不同细胞
不同发育阶段和不同生理病理
状态下的基因差异表达信息
具有时空间特异性
转录组学是在RNA水平上研究基因表达情况
是研究细胞表型和功能的一个重要手段
狭义的转录组学特指
针对mRNA的研究
是功能基因组学的重要分支
但转录组学研究中介入了时空间特异性
同一细胞在不同的生长时期及生长环境下
其基因表达情况是不完全相同的
根据其研究对象
基因组 转录组和蛋白质组
分为基因组学 转录组学和蛋白质组学
其中转录组学是基因组功能研究的一个重要部分
主要包括大规模基因表达谱分析和功能注释
大规模分析基因表达谱
或“全景式”表达谱是生物体
在某一状态下基因表达的整体状态
其采用的手段包括
基因表达谱微阵列或基因芯片
鉴定基因表达信息及表达丰度
所采用的研究手段是基因表达系列分析(SAGE)
和大规模平行信号测序系统(MPSS)
转录组学用于推断未知基因功能
通过获得特定条件下基因表达的信息
使用基因碱基序列数据
以及比较已知和未知功能的基因
推断相应未知基因的功能
揭示特定调节基因的作用机制
基因表达谱
是指任何一种细胞在特定条件下
所表达的基因种类和数量都有特定的模式
而基因表达谱决定着细胞的生物学行为
转录组学
阐明生物体或细胞在特定生理或病理状态下
表达的所有种类的RNA及其功能
其研究重要技术包括微阵列 SAGE和MPSS
微阵列是大规模基因组表达谱研究的主要技术
通过探针与标记的DNA或互补DNA进行杂交
可进行定量分析
对大量基因组甚至整个基因组的基因表达
进行对比分析是其优点
SAGE在转录物水平研究细胞或组织基因表达模式
它可提供生物体基因表达谱信息
定量比较不同状态下
组织或细胞的所有差异表达基因
MPSS是以基因测序为基础的
基因表达谱自动化和高通量分析新技术
通过标签序列获得基因表达水平
可在短时间内检测细胞
或组织内全部基因的表达情况
转录组学的核心任务
高通量转录组测序
是获得基因表达调控信息的基础
转录组测序即RNA测序
研究对象为特定细胞在某一功能状态下的
所能转录出来的所有RNA
单细胞转录组为解析单个细胞行为的
分子基础提供了新方向
单细胞测序解决了其他方法
不能解决的细胞异质性难题
可在全基因组内挖掘基因调节网络
连续追踪疾病基因表达的动态变化
监测病程变化和预测疾病预后
转录组学在医学上的应用
疾病转录组学是通过
比较研究正常和疾病条件下
或疾病不同阶段基因表达的差异情况
为阐明复杂疾病的发生发展机制
筛选新诊断标志物
鉴定新药物靶点
发展新疾病分子分型技术
以及开展个体化治疗提供理论依据
它可阐明复杂疾病发生机制
发现新药物靶点
提供新疾病诊断标志物
指导临床个体化治疗
好的 这一节我们就学习到这了
-第1节 分子生物学的定义
--分子生物学的定义
-第2节 分子生物学的主要研究内容
-第3节 分子生物学发展简史与学习方法
-第一章 测试
-第一章 课件
--第一章 课件
-第1节 染色体
--染色体
-第2节 染色体病与染色体畸变
-第3节 常染色体病
--常染色体病
-第4节 性染色体病
--性染色体病
-第二章 测试
-第二章 课件
--第二章 课件
-第1节 细胞凋亡概述
--细胞凋亡概述
-第2节 细胞凋亡的分子机制
-第3节 细胞凋亡与疾病
--细胞凋亡与疾病
-第4节 细胞凋亡的检测
--细胞凋亡的检测
-第三章 测试
-第三章 课件
--第三章 课件
-第1节 单基因病的概念
--单基因病的概念
-第2节 常染色体显性/隐性遗传病
-第3节 X连锁显性/隐性遗传病
-第4节 Y连锁遗传病
--Y连锁遗传病
-第四章 测试
-第四章 课件
--第四章 课件
-第1节 基因的概念和组构
--基因的概念和组构
-第2节 基因分型
--基因分型
-第3节 基因组
--基因组
-第五章 测试
-第五章 课件
--第五章 课件
-第1节 基因结构与功能的生物信息学分析原理
-第2节 基因启动子及调控序列的结构分析方法
-第3节 基因编码区结构分析方法
-第4节 基因功能分析方法
--基因功能分析方法
-第六章 测试
-第六章 课件
--第六章 课件
-第1节 DNA甲基化与基因表达的表观遗传调控
-第2节 组蛋白修饰与基因表达的表观遗传调控
-第3节 染色质重塑与基因表达的表观遗传调控
-第七章 测试
-第七章 课件
--第七章 课件
-第1节 基因治疗的策略
--基因治疗的策略
-第2节 基因转移技术
--基因转移技术
-第3节 基因干预
--基因干预
-第4节 基因治疗的应用研究
-第八章 测试
-第八章 课件
--第八章 课件
-第1节 蛋白质分子的折叠
--蛋白质分子的折叠
-第2节 蛋白质分子的定位
--蛋白质分子的定位
-第3节 蛋白质的修饰
--蛋白质的修饰
-第4节 蛋白质的降解
--蛋白质的降解
-第九章 测试
-第九章 课件
--第九章 课件
-第1节 长链非编码RNA
--长链非编码RNA
-第十章 测试
-第十章 课件
--第十章 课件
-第1节 基因组学
--基因组学
-第2节 转录组学
--转录组学
-第3节 蛋白质组学
--蛋白质组学
-第4节 其他组学
--其他组学
-第十一章 测试
-第十一章 课件
--第十一章 课件
-第1节 PCR技术概述
--PCR技术概述
-第2节 PCR实验要点
--PCR实验要点
-第3节 PCR的应用及其衍生技术
-第十二章 测试
-第十二章 课件
--第十二章 课件
-第1节 蛋白质印迹概述
--蛋白质印迹概述
-第2节 蛋白质印迹实验流程
-第3节 蛋白质印迹常见问题分析
-第十三章 测试
-第十三章 课件
--第十三章 课件
-第1节 神经示踪的定义、用途、原理
-第2节 示踪剂的要求和分类
-第3节 神经示踪的应用
--神经示踪的应用
-第十四章 测试
-第十四章 课件
--第十四章 课件
-第1节 遗传修饰动物概述及应用
-第2节 动物遗传修饰策略
--动物遗传修饰策略
-第3节 遗传修饰常用技术
-- 遗传修饰常用技术
-第4节 动物遗传修饰实验方法
-- 动物遗传修饰实验方法
-第十五章 测试
-第十五章 课件
--第十五章 课件