当前课程知识点：分子生物学 > 第十一章 常用组学研究 > 第4节 其他组学 > 其他组学
大家好
我是来自中南大学湘雅三医院的袁腊梅
这一章我们学习的内容是常用组学研究
这一节学习内容是其他组学
组学包括基因组学 转录组学 蛋白质组学
此外还包括代谢组学 免疫组学
糖组学以及脂类组学等
我们先来讲一下代谢组的概念
代谢组是指某一细胞 组织 器官
或体液中所产生的所有代谢组分
尤其是相对分子量小于1000的小分子物质
代谢组学是通过对某一细胞 组织 器官或体液内
（尤其是小分子）代谢物进行高通量检测
定性和定量分析
研究生物体整体或组织细胞系统的动态代谢变化
尤其是内源代谢 遗传变异 环境变化
及各种物质进入代谢系统的调整和影响
并寻找代谢物与生理病理变化
相对应关系的研究方式的科学
代谢组学同以基因 RNA和蛋白质
为研究对象的基因组学
转录组学和蛋白质组学一样
是属于系统生物学的重要组成部分
生命体的本质特征是代谢
代谢异常不仅是疾病的一种重要表现形式
也是疾病发生发展的重要机制
蛋白质功能障碍是代谢异常发生的基本分子基础
代谢异常可在多水平通过多种途径引起
代谢组学的应用包括
在疾病诊断方面
可以通过病理生理变化导致代谢产物的变化
寻找疾病标志物
与心脑血管疾病 冠心病和高血压疾病等
与肿瘤 可以找出适当的肿瘤标记物
用于早期诊断和治疗
与肝肾功能疾病
由于肝脏和肾脏是属于重要的代谢器官
病变时可以涉及代谢物组的变化
与内分泌系统疾病
血清和尿代谢物组的变化与诊断相关
此外还在器官移植 临床生殖
营养药物代谢和环境检测等方面相关
除上述的代谢组学外
我们还介绍免疫组学 糖组学 脂类组学三个概念
免疫组学重点的研究是
与免疫相关的全套分子 作用靶分子及其功能
包括免疫基因组学 免疫蛋白质组学
和免疫信息学三方面的研究
糖组学是从分析和破解生物体
或细胞全部糖链所含信息入手
研究糖链的分子结构 表达调控
功能多样性以及与疾病关系的学科领域
脂类组学是代谢组学的一个分支
是用系统的方法分析所有的脂类
与其相互作用的分子
以及在生物体内的作用的一个研究领域
研究组学 其中必不可分的是生物信息学
因此我们来介绍一下生物信息学的概念
生物信息学是一门新的前沿交叉学科
它采用数理和信息科学的理论
技术和方法研究生命现象
理解和组织与生物分子相关的信息
包括生物信息采集 处理 存储 传播 分析和注释等
其研究平台主要包括三个大方面
即数据库 计算机网络和应用分析软件
其研究目标包括破译DNA序列的遗传语言
揭示基因组的信息
结构复杂性和基因表达规律
认识生命活动的基本规律
发现生命起源 进化 遗传和发育的本质
揭示生理和病理过程的分子基础
生物信息学的主要任务包括以下几个部分
获取完整基因组的序列
发现新基因和新SNP位点
获取蛋白质组学信息
蛋白质结构预测
生物信息分析技术与方法研究
生物信息学的研究内容有很多
如生物分子数据的收集 存储和管理
数据库查询及序列比对分析
分子进化和基因组比较研究
发现新基因及基因单核苷酸多态性
基因组序列信息提取和分析
蛋白质结构比对等
常用的生物信息学数据库包括
核酸数据库 蛋白质数据库等
其中应用最为广泛的核酸数据库
序列数据库GenBank EMBL DDBJ
二级数据库和晶体数据库等
蛋白质数据库包括序列数据库和结构数据库等
NONCODE是指的非编码RNA组科学数据库
还有一些序列比对工具
如BLAST
还包括其他在线生物信息学分析工具
生物信息学在功能基因组学中的应用
通过利用生物信息学所提供的信息分析
再根据不同的目的采用不同研究手段
在基因组水平全面分析基因功能
可以发现新基因
通过对基因区域和基因功能的预测
解读序列 通过BLAST发现相似序列等
基因组编码区预测 数据库相似性搜索法
生物信息学分析需要掌握相关数据库的使用
这里我们介绍一下NCBI数据库
这个是NCBI的主页
其左侧有NCBI数据库的所有数据资源
右侧有一些常用的数据库
如BLAST PubMed等
OMIM数据库即在线人类孟德尔遗传数据库
它包括迄今为止所有已知人类遗传病
遗传决定性状及其相关基因
各种疾病的临床特征 诊断
鉴别诊断 治疗和预防等相关信息
已知有关致病基因的连锁关系
染色体定位 组成结构和功能及动物模型等资料
并附相关的参考文献
持有一套独特的编号系统
制定的各遗传病 性状和基因的统一编码系统
为全球所公认
下面是NCBI数据库提供的OMIM的链接
好的
这一节我们的内容就学到这了
-第1节 分子生物学的定义
--分子生物学的定义
-第2节 分子生物学的主要研究内容
-第3节 分子生物学发展简史与学习方法
-第一章 测试
-第一章 课件
--第一章 课件
-第1节 染色体
--染色体
-第2节 染色体病与染色体畸变
-第3节 常染色体病
--常染色体病
-第4节 性染色体病
--性染色体病
-第二章 测试
-第二章 课件
--第二章 课件
-第1节 细胞凋亡概述
--细胞凋亡概述
-第2节 细胞凋亡的分子机制
-第3节 细胞凋亡与疾病
--细胞凋亡与疾病
-第4节 细胞凋亡的检测
--细胞凋亡的检测
-第三章 测试
-第三章 课件
--第三章 课件
-第1节 单基因病的概念
--单基因病的概念
-第2节 常染色体显性/隐性遗传病
-第3节 X连锁显性/隐性遗传病
-第4节 Y连锁遗传病
--Y连锁遗传病
-第四章 测试
-第四章 课件
--第四章 课件
-第1节 基因的概念和组构
--基因的概念和组构
-第2节 基因分型
--基因分型
-第3节 基因组
--基因组
-第五章 测试
-第五章 课件
--第五章 课件
-第1节 基因结构与功能的生物信息学分析原理
-第2节 基因启动子及调控序列的结构分析方法
-第3节 基因编码区结构分析方法
-第4节 基因功能分析方法
--基因功能分析方法
-第六章 测试
-第六章 课件
--第六章 课件
-第1节 DNA甲基化与基因表达的表观遗传调控
-第2节 组蛋白修饰与基因表达的表观遗传调控
-第3节 染色质重塑与基因表达的表观遗传调控
-第七章 测试
-第七章 课件
--第七章 课件
-第1节 基因治疗的策略
--基因治疗的策略
-第2节 基因转移技术
--基因转移技术
-第3节 基因干预
--基因干预
-第4节 基因治疗的应用研究
-第八章 测试
-第八章 课件
--第八章 课件
-第1节 蛋白质分子的折叠
--蛋白质分子的折叠
-第2节 蛋白质分子的定位
--蛋白质分子的定位
-第3节 蛋白质的修饰
--蛋白质的修饰
-第4节 蛋白质的降解
--蛋白质的降解
-第九章 测试
-第九章 课件
--第九章 课件
-第1节 长链非编码RNA
--长链非编码RNA
-第十章 测试
-第十章 课件
--第十章 课件
-第1节 基因组学
--基因组学
-第2节 转录组学
--转录组学
-第3节 蛋白质组学
--蛋白质组学
-第4节 其他组学
--其他组学
-第十一章 测试
-第十一章 课件
--第十一章 课件
-第1节 PCR技术概述
--PCR技术概述
-第2节 PCR实验要点
--PCR实验要点
-第3节 PCR的应用及其衍生技术
-第十二章 测试
-第十二章 课件
--第十二章 课件
-第1节 蛋白质印迹概述
--蛋白质印迹概述
-第2节 蛋白质印迹实验流程
-第3节 蛋白质印迹常见问题分析
-第十三章 测试
-第十三章 课件
--第十三章 课件
-第1节 神经示踪的定义、用途、原理
-第2节 示踪剂的要求和分类
-第3节 神经示踪的应用
--神经示踪的应用
-第十四章 测试
-第十四章 课件
--第十四章 课件
-第1节 遗传修饰动物概述及应用
-第2节 动物遗传修饰策略
--动物遗传修饰策略
-第3节 遗传修饰常用技术
-- 遗传修饰常用技术
-第4节 动物遗传修饰实验方法
-- 动物遗传修饰实验方法
-第十五章 测试
-第十五章 课件
--第十五章 课件
