当前课程知识点:精准医学 > 第六章 精准医学与乳腺肿瘤 > 2.精准医学中的标本库平台建设 > 2
同学们好
这次我给大家讲一下精准医学与乳腺肿瘤方面的一些知识
我来自山东大学齐鲁医院乳腺外科
我的专业是一名外科医生
下面我要讲一下“精准医学中的标本库平台建设”
精准医学标本库平台的建设
它的意义重大
我们要进行信号转导通路的研究
要进行干细胞的研究
生物芯片信息的分析
肿瘤的药物敏感性的研究
这些都需要一个标本库的平台
这恰恰是好多医院
本来可以收集到好多标本
所欠缺的一个平台
我们山东大学齐鲁医院
也是相对比较早开启了标本库平台的建设
大家可以看一下
2008年的时候我回国一年
我得到医院的支持
就开始进行乳腺肿瘤标本库的建设
设计了一些软件
希望能把我们齐鲁医院治疗的标本收集起来
建起了全省第一家乳腺癌标本库
当然现在在我们院长的支持之下
我们全院又建了一个标本库
有好多机器的设备
特别我们陈院长领导了全国的多中心研究
从国家得到了大量的资金支持
我们可以有这些冰箱
有好多液氮罐
我们存取更高质量的标本
对于肿瘤学来讲对乳腺肿瘤来讲
标本库储存流程我给大家介绍一下
我们血液标本有处理流程
这是血液标本的处理流程
我们要用离心机进行处理
然后提取它的血清血浆进行分装进行保存
对于组织的标本也是这样
我们在手术台上可以迅速的来进行切割
无菌条件之下切割下来
有时候我们可以提取DNA RNA 蛋白进行储存
病理诊断分析的标本
我们也可以收集起来
蜡块储存起来
后续我们做组织芯片
我们做外科医生可以有好的条件存取最优质的标本
为什么这么说
如果这个标本离体了
可能一段时间之后RNA就会降解
我们手术台上可以用最快的时间切取标本进行储存
而且在手术台上
我们可以清晰的辨认哪个地方是真正的肿瘤
哪个地方是正常的组织
哪个地方是肿瘤周围的正常组织
这是我们标本储存的流程
在手术台上我们可以在肿瘤正中间切下一薄片
这个整个的一薄片才是代表整个肿瘤的全貌
我们可以进行分割
在无菌的条件下
迅速地分割
然后放到PBS里
有时候可以放到RNA later里面防止RNA的丢失
然后迅速地转移到实验室进行储存
当然 我们可以进一步切取周围的正常组织
可以切取远离癌的正常组织
做好很好的标记送到标本库
这样为后期我们肿瘤和正常组织的对照研究
配合血液标本一整套的标本
为后续的转化医学研究 精准医学的研究奠定重要的基础
这是分装
这是肿瘤和正常组织
在精准医学的时代
其实我们研究要注意精准
如果你把正常和肿瘤标反了
可能后续到了实验室别人就不知道
后续科学家用这个标本做研究的时候也可能正常当成了肿瘤
肿瘤当成了正常
造成了我们精准医疗时代不精准
这是入库和出库的一个流程
我们分装这些标本之后进行条码打码之后
储存到冰箱的相应的位置
应用计算机的软件进行管理
因为软件很好的标记
在出库的时候
可以在相应的位置给它标记
哪一个管可能是用了多少
或者已经用空了
这样的话就有一个很好的管理
现在我们到了一个电子化的时代
我们标本库也是很好的一个电子化的管理
这是到目前为止我们存的一些标本
这些标本具有详细的信息
正常 肿瘤
我们很感激我们医院给我们搭建这个平台
山东大学临床标本库
齐鲁医院疾病标本库
我们这好多的标本有一个好的储存空间
而且我们有一个质控的系统
这质控的系统是什么呢
如果这个标本储存了一段时间
它是不是RNA出现降解了
我们找一些原因
在哪个环节出问题
也可能离体了之后
我们临床医生可能没有做科研的经验
放了两个小时
他才让标本库进行分装保存
这些可能的环节都会影响标本的质量
而且在标本出库入库的过程当中
都会对冰箱进行开门关门
标本反复的冻融的情况
我们标准库就是进行这种质量控制的工作
也可以为世界提供第一手的资料
一个标本库需要更好的信息
什么信息呢
我们需要临床的信息
需要随访的信息
在2007年我就为了这种随访设计了这个表
当时我们手机并不是实名化的时代
当时只要是花钱就可以办一个临时卡
但是虽然是临时卡
不会所有的人都会是临时卡
当时为设计这个表
每一个患者他要留下三个亲属的联系方式 地址
包括电话
最好单位电话 固定电话要留下
这样就为后续的随访而服务
另外每年我们的学生团队都要进行数据的整理
因为现在的病历系统不利于我们做这种整理
虽然来说是病历电子化
但是做一些统计学分析等等数据的提取
并不能完全实现智能
我们需要定时进行分析 总结患者的一些资料
用我们的模式进行整理
和我们标本库的标本进行对接
这是我们每一年做的随访的资料
右边这一个就是当时我回国以后
我在看门诊的时候
一开始我要自己登记
每个患者回来进行复查的时候
我要进一步登记他的信息
他哪一年做的手术
他后续用药出现什么样的变化
是否出现复发转移
这样不断的进行拦截追击
让我们的数据库更加完善
更有利于我们做转化医学的研究
2016年我们设计了另一个表
什么表呢
我们希望每个患者再回来复查的时候都要拿着这个表
这个表是 复查必带
就是在做手术出院的时候
都要有一个详细的总结
她的病理类型是什么
我们给她制定的后续的治疗方案是什么
特别是病理类型
治疗方案
手术方式等等
我们在看门诊的时候
病人拿这个来
我马上要知道她做了什么手术
是不是药物的后续治疗需要延长时间
这有利于对患者的精准的治疗
我们全省以及全国
听到我这种理念
被好多科室所借鉴
另外就是伦理的问题
我们提到了我们做标本库
我们做这些分析
目前来讲的话
我们好多的工作要和国际接轨
好多要有病人知情同意
所以在2016年我也设计了一个知情同意书
每个患者都要签一个她同意我们把她废弃的组织收集起来进行标本储存
作为科学研究使用
如果她自愿另外捐献10毫升的血液
我们在适当的时候就抽取10毫升的血液为科学研究使用
如果她不画这个勾我们不会留取她的标本
另外她同意我们随访
我们才可能对她们进行随访
这些都是我们要和国际接轨
我也是在我们全院率先提出来这一种知情同意收集的文书
也经过了伦理委员会的批准
谢谢
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