当前课程知识点:基础生物化学实验 > 第四章 酶活力的测定 > 第三节 酶米氏常数的测定 > 菠萝蛋白酶米氏常数的计算(Folin酚法)
1. 顺利完成了菠萝蛋白酶米氏常数的测定实验后,我们得到了一系列的实验数据,
而且同学们已经学习过双倒数作图法计算米氏常数KM的思路和注意事项,所以请你自己练习用这组数据计算一下菠萝蛋白酶的米氏常数KM。接下来,我们一起来看看,你的计算过程和结果与我们的计算过程是否一致吧。
米氏方程双倒数作图的公式是
需要用1/[S]为横坐标,以1/v为纵坐标作图,所以我们要分别计算每支酶反应管里的底物浓度[S]和反应速度v。
2. 我们先来计算每支酶反应管里的反应速度,也就是每支管中每分钟生成酪氨酸的浓度,要知道各管中的酪氨酸的浓度,第一步,先要计算酪氨酸标准曲线浓度
3. 绘制酪氨酸浓度标准曲线
4. 接下来,计算不同底物浓度的酶反应管中在酶促反应时间生成的产物吸光度,也就是用各测定管的吸光度值减去空白管的吸光度值。
5. 利用酪氨酸浓度标准曲线的拟合方程,计算出各酶反应管中生成的酪氨酸浓度
6. 接下来,我们需要计算各酶反应管中的反应速度,反应速度应该是每分钟生成酪氨酸的浓度,请注意,这里关键的问题是,计算哪个体系中的酪氨酸浓度?
是缓冲液+酪蛋白+酶液的2 ml体系,还是缓冲液+酪蛋白+酶液+三氯乙酸的3 ml体系呢?
我们在前面的学习中已经详细讨论过,应该计算缓冲液+酪蛋白+酶液的“酶反应体系”,也就是2ml体系中的酪氨酸浓度。
7. 而我们现在算出的这些酪氨酸浓度是缓冲液+酪蛋白+酶液+三氯乙酸的3 ml“测定体系”中的酪氨酸浓度,所以这些数值还需要乘以3/2,换算成2 ml“酶反应体系”中的浓度,并除以反应时间10 min,得出各酶反应管的反应速度,并进而计算出各管中的1/v。
8. 此时,我们还需要各酶反应管中的底物浓度,浓度计算的步骤很简单,不过需要确定的是,这个底物浓度不是初始加入的底物浓度,而是2 ml“酶反应体系”中的底物浓度,所以我们需要将初始加入底物的体积乘以10 mg/ml的浓度,再除以2 ml酶反应体系体积,即可得到各酶促反应管中底物的浓度[S],进而计算出1/[S]。
9. 以1/[S]为横坐标,以1/v为纵坐标,绘制双倒数图
10. 我们知道,米氏方程可以写成这种双倒数的形式
我们以1/[S]为横坐标,以1/v为纵坐标绘制的曲线其斜率就等于KM/Vmax,而曲线的纵截距即为1/Vmax,所以,我们的拟合方程中截距34.139 = 1/Vmax,
由此可以计算出Vmax = 1÷截距 = 1/34.139 = 0.029 mg/ml·min,
KM = 斜率÷截距 = 178.02 ÷ 34.139 = 5.215 mg/ml。
11. 好了,计算完了,和你算的一样吗?
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